Это один из трех двусторонних договоров, приостановленных в среду.
Госдепартамент США заявил, что закон О безопасности "сокрушил свободы народа Гонконга".
В прошлом месяце президент Дональд Трамп также прекратил преференциальный торговый и дипломатический статус Гонконга с США.
"Коммунистическая партия Китая решила подавить свободу и автономию народа Гонконга", - написал госсекретарь Майк Помпео в своем твиттере.
Этот шаг был ожидаемым, поскольку США ввели целый ряд карательных мер вслед за новым законом.
Правительство Гонконга позже ответило, заявив, что оно" решительно возражает и сожалеет "против действий США,"которые широко рассматриваются как шаг к созданию проблем в китайско-американских отношениях, используя Гонконг в качестве пешки".
Каковы последние меры?
Они охватывают "выдачу беглых преступников, передачу осужденных лиц и взаимные налоговые льготы на доходы, полученные от международной эксплуатации судов", говорится в заявлении пресс-секретаря Госдепартамента Морган Ортагус.
Приостановление взаимных налоговых льгот, вероятно, нанесет значительный удар по гонконгским компаниям - многие из этих компаний полагались на такие льготы для облегчения бремени.
Другие страны, такие как Великобритания, Германия и Австралия, также приостановили действие договоров об экстрадиции в последние недели.
Ранее в этом месяце администрация Трампа ввела санкции в отношении главы Исполнительной власти Гонконга Кэрри Лам и 10 других высокопоставленных чиновников из Гонконга и материкового Китая.
Также в среду господин Трамп похвалил гонконгского медиамагната Джимми Лая, который был задержан на прошлой неделе в соответствии с законом.
На словах, вызвавших гнев Китая, он назвал 71-летнего господина лая - видного сторонника демократии и сторонника протестов, вспыхнувших в прошлом году в Гонконге,-"храбрым человеком".
Что означает закон О безопасности для Гонконга?
США рассматривают закон О безопасности как угрозу свободам, гарантированным Гонконгом в соответствии с соглашением о передаче власти.
Его особый статус был согласован между Китаем и бывшей колониальной державой Гонконга, Великобританией, прежде чем суверенитет был возвращен Пекину в 1997 году.
Новый закон Китая: почему Гонконг беспокоится?
Закон, запрещающий критику китайского правительства, - это самое радикальное изменение политического ландшафта Гонконга с тех пор.
Критики говорят, что это эффективно ограничивает протест и свободу слова. Но Китай заявил, что новый закон вернет стабильность территории после года беспорядков.